自動核酸蛋白分離層析儀改變了傳統的攪拌方式，采用特制的玻璃反應器。物料被循環泵驅動從底部的貯存室進入反應器的上部，再沿著與光源平行的管壁自上而下的形成薄膜降落、均勻而充分的接受光輻射，流回貯存室。這個過程不斷的循環直至反應結束。
 

　　副反應少、處理量輕松可調物料與光源之間形成薄膜平行降落，充分、并均勻的吸收所需波長光的能量，物料對光子的吸收效率非常高。自動核酸蛋白分離層析儀使得反應物與光源部分不直接接觸，避免中間產物持續的停留在光源部分的表面而導致的不必要副反應。可通過改變物料貯存室輕松提升系統的處理量，循環泵的加入使得該系統尤其適用于大處理量的反應。
 

　　自動核酸蛋白分離層析儀是否一定要評價柱效？
 

　　總體來說，還是建議進行柱效評價的，但柱效評價標準不能一概而論。
 

　　高標準：1)分子篩層析；2)反相層析；3)疏水層析；4)采用階性梯度或線性梯度洗脫的離子交換層析。此類層析對分離度有較高要求，有些需要采用多梯度洗脫或線性洗脫，如果柱效不佳，往往會造成峰擴散或拖尾，會對純化效果產生很大影響。
 

　　低標準：1)親和層析；2)采用單梯度洗脫的離子交換層析。此類層析僅需采用單梯度洗脫，有時在產物洗脫下來后，還要立即進行稀釋，以防產物聚集，因此對分離度要求較低。然而，過于嚴重的峰擴散和拖尾，也是會影響純化效率的，因此柱效測定也*。
 

　　僅要求峰型及對稱性：流穿模式。此類模式為目標產物流穿，雜質被吸附，如果填料裝填不均勻，或者過于松散，仍會導致吸附不勻而影響載量和處理量。因此，評估柱效時建議觀察一下峰型及對稱性，如果峰型平滑，且對稱性良好，即可接受。
 

　　建議標準：0.8